Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms