Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 567.9 ms