Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrp2bpQ9D4C6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms