Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.7 ms