Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgms2Q9D4B1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms