Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933421I07RikQ9D420 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms