Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snrnp35Q9D384 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrnp35Q9D384 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms