Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l4Q9D2A5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Creb3l4Q9D2A5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms