Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hddc3Q9D114 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hddc3Q9D114 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms