Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc7Q9D0M0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms