Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms