Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trmt5Q9D0C4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt5Q9D0C4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms