Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl35Q9CZ49 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl35Q9CZ49 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms