Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bud23Q9CY21 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Bud23Q9CY21 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Bud23Q9CY21 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Bud23Q9CY21 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bud23Q9CY21 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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