Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sgo1Q9CXH7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sgo1Q9CXH7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms