Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Yif1bQ9CX30 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Yif1bQ9CX30 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms