Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms