Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms