Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVB6

Arpc2, Actin-related protein 2/3 complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc2Q9CVB6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc2Q9CVB6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc2Q9CVB6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms