Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms