Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rprd1bQ9CSU0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms