Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ska2Q9CR46 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ska2Q9CR46 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms