Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms