Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PclafQ9CQX4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms