Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpa3Q9CQ71 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms