Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ncbp2Q9CQ49 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ncbp2Q9CQ49 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms