Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NsmfQ99NF2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NsmfQ99NF2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms