Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b1Q99NB9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms