Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hdac9Q99N13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac9Q99N13 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms