Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gins4Q99LZ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms