Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms