Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Sh3bp5lQ99LH9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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