Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp16Q99LG0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp16Q99LG0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms