Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf19Q99KP6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf19Q99KP6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms