Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Lmo1Q924W9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lmo1Q924W9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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