Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms