Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clip1Q922J3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clip1Q922J3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms