Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smarca5Q91ZW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarca5Q91ZW3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms