Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rpe65Q91ZQ5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpe65Q91ZQ5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpe65Q91ZQ5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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