Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Pde6cQ91ZQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pde6cQ91ZQ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pde6cQ91ZQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Pde6cQ91ZQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde6cQ91ZQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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