Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcdhga12Q91XY7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms