Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdc42ep1Q91W92 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc42ep1Q91W92 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms