Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csde1Q91W50 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms