Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc115Q8VE99 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc115Q8VE99 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms