Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf4Q8VE97 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf4Q8VE97 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms