Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4Q8VCH8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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