Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgef3Q8VCC8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rapgef3Q8VCC8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
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