Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RttnQ8R4Y8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RttnQ8R4Y8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms