Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc12Q8R344 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms