Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg10Q8R1P4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms